伊犁州新华医院
伊犁州新华医院是一所集医疗、教学、科研、预防、康复于一体的国家级三级综合医院，爱婴医院、北疆唯一一家“微笑列车”唇腭裂修复慈善项目定点医院，自治区包虫病外科手术定点医院，自治区人民医院“医疗集团联合体”合作单位，同时挂牌“伊犁州直艾滋病抗病毒定点医院”、“伊犁州职业病医院”、“伊犁州耐多药结核治疗定点医院”。先后获得自治区级文明单位、自治区行业作风建设先进集体、自治州民族团结进步模范单位、州直卫生系统先进集体、伊宁市综合治理先进单位等荣誉称号。现有职工964人，高级职称107人，中级职称176人；少数民族
新疆生产建设兵团第七师医院
第七师医院1994年12月建院，经过20多年的发展，目前已经成为是一所集医、教、研、康复、保健为一体的“三级甲等综合医院”。同时，是石河子大学医学院教学医院和国家爱婴医院。
新疆塔城地区人民医院
塔城地区人民医院始建于1936年，是一所集医疗、教学、科研于一体的三级甲等综合医院。担负塔城地区北四县（市）各族群众的医疗和保健工作，医院还承担地区传染病医院、地区紧急救援中心和地区精神卫生中心的管理服务职能。
新源县中医医院
新源县中医院位于新疆维吾尔自治区省新疆伊犁州新源县县城，是一家中医医院。
巩留县人民医院
巩留县人民医院建于1944年7月，在各级党委和政府的关怀下，2011年7月异地新建搬迁，现已成为国家二级甲等医院、国家级“爱婴”医院、自治区级文 明单位、州级民族团结模范单位及先进基层党组织、优秀带教示范基地。是巩留县唯一一所集医疗、教学、预防、保健、康复为一体的综合性医院，担负着全县 20.4万人的医疗保健工作，是巩留县基本医疗保险定点医院和新型农村合作医疗定点机构。
乌苏市人民医院
乌苏市人民医院是一所国家二级甲等医院，注册床位349张，实际开放500张；职工502人,其中高级职称53人，中级职称82人，占职工总数的26.9%；现有12个临床科室，其中妇产科、外科为地区重点科室，儿科、内二科为市级重点科室。
新疆伊犁州奎屯市奎屯医院
新疆伊犁哈萨克自治州奎屯医院位于北疆交通中心城市奎屯市。奎屯市东距乌鲁木齐250公里，与克拉玛依市、乌苏市、沙湾县、独山子石化基地接壤，扇形辐射伊犁、塔城、阿勒泰、博乐等地区和新疆北部所有的边境口岸。
霍尔果斯市人民医院
霍尔果斯市人民医院是一所集医疗、教学、急救、科研、预防保健和康复治疗为一体的，环境优美、功能齐全、设备先进、技术优良的综合医院，是新疆维吾尔自治区中医医院医疗技术协作医院、连云港市妇幼保健院友好合作医院、新疆医科大学附属肿瘤医院远程医疗协作单位、伊犁州新华医院医联体成员单位、国家精神心理疾病临床医学研究中心新疆分中心联盟单位、新疆眼耳鼻喉专科联盟单位、伊犁州领军专家郭永忠胃肠包虫病工作室、伊犁丝路职业学院（卫生健康学院分院）定点教学医院。
伊犁哈萨克自治州友谊医院
新疆伊犁哈萨克自治州友谊医院始建于1936年，是集医疗、科研、教学和预防保健为一体的地、州级医院。现为国家三级甲等医院和爱婴医院，新疆医科大学教学医院、自治区十佳医院和自治区级文明单位。
伊犁州中医医院
伊犁哈萨克自治州中医院是一所集医疗、教学、科研、预防保健、康复为一体的三级甲等中医医院，医疗用地面积3000多平方米，年门诊量近100000人次，年收治住院患者4000人次，手术量3000多台。医院拥有专家学者200余名，其中高级专家学者14名，中级以上专业技术人员占40%，院内职工由10余个民族组成，是一个各民族团结和睦的大家庭。
兵团奎屯中医院
兵团奎屯中医院成立于2002年12月，目前全院拥有中医内科、外科、针灸推拿理疗科、肛肠科等临床科室，检验、B超，心电、放射、CT、中、西药房等医技科室，拥有妇科、皮肤、小针刀等特色门诊，现开放床位数100张，人员93人，其中专业技术人员76人（医生：28人，医技：10人，护理：30人，药剂：8人）；医院现有院领导四名，其中院长一名，副院长二名，工会主席一名；设有医务科、护理部、办公室、院感办、医保办等职能部门；2010年实现财务总收入：1143万元，出院病人数：1693人，门诊诊疗人次：10667人次。
伊宁县人民医院
新疆伊宁县位于新疆伊犁哈萨克自治州，离首府伊宁市18公里，全县有45万人口，由维吾尔族、汉族、哈萨克族、回族等28个民族组成，是新疆北疆片区第一人口大县。成立于1952年的伊宁县人民医院是国家“二级甲等医院”、国家级“爱婴”医院、国家孕产妇质量监测医院、自治区包虫病手术治疗定点医院，是江苏省南通市卫生系统对口援疆单位，新疆医科大学第一附属医院、自治区人民医院远程会诊网络（协作）医院。近年来医院荣获了星耀中华最具成长力中国县市医院—管理之星奖，2017、2018连续两年跻身中国医院竞争力·排行榜县级医院30